精神

在孤独症谱系障碍儿童中,染色体微阵列分析与全外显子组测序的分子诊断阳性率

作者:吴峰 译 来源:中国医学论坛报 日期:2015-09-24
导读

         在孤独症谱系障碍儿童中,染色体微阵列分析与全外显子组测序的分子诊断阳性率

        克里斯蒂娜·塔姆米麦斯(Tammimies)等加拿大安大略省多伦多市病童医院遗传学与基因组生物学项目应用基因组学中心等

        意义 关于采用全基因组检测对自闭症谱系障碍(ASD)个体进行分子诊断,尚需要进行更多的研究。

        目的 在一个罹患ASD儿童的异质性群组中,进行染色体微阵列分析(CMA)和全外显子组测序(WES),以确定这些检测在儿科发育诊所典型样本中的分子诊断阳性率

        设计、机构和参与者 该样本包含258例连续、确诊、相互无关的ASD儿童,这些儿童接受了详细评估,以基于有严重先天性异常和轻微躯体异常来定义形态学评分。2008-2013年期间,在加拿大纽芬兰省和拉布拉多省纳入儿童。先证者被分层为形态学严重度递增的3组:基础型、中间型、复杂型(评分为0~3分、4~5分和≥6分)。

        暴露 所有的先证者均接受CMA检测,在95组先证者-父母三人组中进行WES检测。

        主要转归和测量指标 CMA和WES在一个基于人群、分为3个表型组ASD样本中的所有分子诊断阳性率。

        结果 在258例先证者中,有24例[9.3%,95%可信区间(CI)为6.1%~13.5%]接受了CMA检测的分子诊断,95组中有8组(8.4%,95%CI为3.7%~15.9%)接受WES检测的分子诊断。在不同的形态学组间,诊断阳性率存在统计学差异。在接受了CMA与WES两项检测的儿童中,存在可辨别的遗传性病因学儿童的估算比例为15.8%(95%CI为9.1%~24.7%,15/95例儿童)。其中包括2例接受来自两种检测的分子诊断儿童。复杂型组的联合诊断阳性率明显高于基础型组(成对比较的P值为0.002)。

        结论和相关性 在这组ASD儿童的异质性样本中,CMA和WES的分子诊断阳性率具有可比性,较为复杂形态学表型儿童中的联合分子诊断阳性率高于基础型儿童。如果这些结果能在其他人群得到复制,则有可能为ASD受累儿童分子诊断检查的适当选择提供信息。

        [JAMA2015,314(9):89-903.doi:10.1001/jama.2015.10078]

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